O DHAP tem a seu cargo diversos cursos integrados nos vários ciclos de Bolonha, bem como cursos livres de realização periódica.
Licenciatura (1º Ciclo de Bolonha)
- Conservação e Restauro (actualmente não está em funcionamento)
Os licenciados por estes cursos estão habilitados a apoiar os trabalhos de planeamento urbanistíco e territorial. Estão ainda preparados para integrar equipas de reabilitação dos sítios e edifícios com valor histórico e arquitectónico, e para desenvolver um vasto conjunto de tarefas nos domínios da identificação, estudo e valorização do património construído e arqueológico.
Os licenciados em Arqueologia estão habilitados à prática de trabalhos arqueológico, mediante autorização pelo IGESPAR.
Pós-Graduação (2º Ciclo de Bolonha, sem conferência de grau)
Mestrado (2º Ciclo de Bolonha)
- Portugal Islâmico e o Mediterrâneo (em colaboração com o Campo Arqueológico de Mértola)
- Mestrado Europeu em Gestão do Património (em preparação)
Doutoramento (3º Ciclo de Bolonha)
Apesar de não funcionarem ainda cursos com parte lectiva, existe um leque alargado de especialidades de doutoramento conferidos pela Universidade do Algarve nas áreas científicas ministradas pelo DHAP: ramos de Arqueologia, História e História de Arte.
Cursos Livres
- História do Algarve (2004-2009; seis edições a realizar em Julho)
- Zooarqueologia